S-a dovedit, de asemenea, că pelinul are activitate antibacteriană și antifungică puternică.

Diferiți compuși sunt considerați responsabili pentru aceste efecte, inclusiv substanțe chimice numite terpene care conferă anumitor plante mirosul lor aromat. Aceasta include o terpenă numită camfor.

Pelinul a demonstrat activitate împotriva Streptococcus aureus, o bacterie care este una dintre principalele cauze ale infecțiilor cutanate și ale țesuturilor moi.

Aceasta include o formă potențial gravă numită Staphylococcus aureus rezistent la meticilină (MRSA).